Острые инфекционные заболевания нервной системы
В 1945–60 гг. сотрудниками Института неврологии АМН СССР получены приоритетные данные о краевой патологии острых нейроинфекций Советского Союза: открыты и описаны омская и крымская геморрагические лихорадки, джулангарский энцефалит, внесен значительный вклад в изучение японского и клещевого энцефалитов, острого эпидемического полиомиелита.
В результате проведенных фундаментальных вирусологических, клинико-иммунологических и экспериментальных исследований были установлены особенности распространения и механизмы инфекционного процесса при остром эпидемическом полиомиелите у детей и взрослых; на этой основе разработана стройная система мероприятий, принципиально изменивших ситуацию с этим тяжелым заболеванием в нашей стране, а созданные позднее вакцины позволили практически ликвидировать полиомиелит в СССР.

Многолетние клинико-вирусологические исследования, проводимые в Институте неврологии, подготовили почву для зарождения в его недрах Института полиомиелита и вирусных энцефалитов, который в 1955 году стал самостоятельным научно-исследовательским учреждением (первый директор – М.П. Чумаков, перешедший в Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов со своей лабораторией из Института неврологии АМН СССР).
Сосудистые заболевания головного мозга
В 1950–1990 гг. Институтом неврологии АМН СССР были сделаны пионерские, основополагающие шаги по изучению сосудистых заболеваний нервной системы и созданию целостной
системы борьбы с инсультом в нашей стране (Е.В. Шмидт, Н.В. Верещагин, В.Е. Смирнов, А.Н. Колтовер и др.):

С целью дальнейшего развития научных, организационных и медицинских основ оказания помощи больным с ОНМК на базе Института в 1999 году был создан
Научный центр по изучению инсульта Минздрава России. По итогам первых 10 лет работы Научного центра по изучению инсульта можно выделить ряд следующих наиболее значимых результатов, подтвердивших обоснованность его создания: